明朝

明成化七年（1471年）冬十月因运河堵塞设立，并将漕河以南直隶徐州沛县、山东省济南府德州为界分为三段，命刑部侍郎王恕总督河道，亦称总理河道总管河道大臣。成化九年（1473年）四月王恕改任南京户部左侍郎后不复常设，闻河有故则遣大臣行事往治之，事毕还朝。正德四年（1509年）九月黄河自仪封北决，越黄陵冈，入贾鲁河，抵丰沛，威胁安平运道，十二月武宗命工部左侍郎崔岩兼都察院右副都御史署理河道，驻扎济宁。但正德五年（1510年）九月崔岩治河未济，被刘瑾迫害致仕，武宗将南京右佥都御史李堂升任工部右侍郎，继续整治河道。正德六年（1511年）二月功成。十二月因刘六刘七民变，命捕盗都御史陈天祥管治山东省东昌府以北河道，漕运都御史张缙管治南直隶徐州以南河道，苏松巡抚河道总督管治东昌府至徐州沛县河道以守河运。正德七年（1512）三月以鸿胪寺卿刘恺为都察右副都御史总都河道，遂成定职，任期三年。嘉靖十三年（1534年）以都察御史加工部尚书或侍郎职衔充任。隆庆四年（1570年）兼领军务。到万历五年（1577年）因河道总督傅希挚与漕运总督吴桂芳因整修河道分歧太大无法调和，内阁首辅张居正并河于漕，升总督漕运兵部左侍郎吴桂芳为工部尚书河漕总督兼领军务，新任总河。还未上任的新河道总督李世达改任浙江巡抚。万历十六年（1588年）四月直隶巡按御史见并河于漕后责分，而官无专督，故修浚之功怠于无事，急于临渴，河患日深，遂上奏奏请河漕分开并重设河道总督。经内阁讨论后神宗批准同意，此后沿用至清朝。

清朝

清朝沿用。后分设为三位河道总督。分别是

• 南河总督驻江苏省淮安府清江浦

• 东河总督驻山东省济宁州

• 北河总督由直隶总督兼领。

并依需要另设副总河。

;未分设之前的历任总督

注释