生平
嘉靖二十八年（1549年）己酉科浙江乡试举人，三十二年（1553年）癸丑科三甲第十一名进士。礼部观政，授松江府推官，任内抵御倭寇进犯，升刑科给事中，弹劾罢免严嵩党羽、兵部尚书许论、宣大总督杨顺及巡按御史路楷。不久出使琉球，未遂。三十七年（1558年）再次弹劾严嵩，因其为徐阶弟子，下狱后，张翀、董传策、吴时来三人被拷问谁是主使，三人均不承认。不久，吴时来被贬戍横州。
隆庆元年（1567年）二月升吏科右给事中，四月升工科左给事中，举荐谭纶、俞大猷、戚继光等人北上镇守边疆。出为抚治郧阳，弹劾右佥都御史刘秉仁，十一月升顺天府府丞，二年（1568年）三月任南京都察院右佥都御史、提督操江，四年（1570年）三月改巡抚广东。但吏科都给事中光懋等弹劾他滥为举荐他人，五月吏部尚书高拱趁机贬吴时来为云南按察司副使，五年（1571年）二月再为高拱门生吏科都给事中韩楫所劾，罢职冠带闲住。
明神宗即位，累荐不起。万历十二年（1584年）十月，以户科右给事中周世选举荐，起为湖广按察司副使，十二月改任通政使司左通政，十三年（1585年）六月升大理寺卿，九月升刑部右侍郎，十四年（1586年）二月改任吏部右侍郎，十五年（1587年）三月任都察院左都御史，弹劾诚意伯刘世延怙恶抗旨。虽然吴时来早年弹劾权贵声震朝野，但是因这十馀年的挫折，他的晚年更多是在权贵间虚与委蛇。不久，东林党人饶伸、薛敷教、王麟趾、史孟麟、赵南星、王继光接连弹劾吴时来，吴时来被迫辞职，未离京师之前，就已去世，赠太子太保，諡忠恪。礼部仪制司郎中于孔兼反对，被夺諡。
家族
祖父吴荣赞，义官；父吴炳台，生员。母王氏。弟吴时教（生员）、吴时永。
有子吴锡岱。
著作
著有《横槎集》。
其他
2007年，由国家广播电影电视总局电影卫星频道节目制作中心和北京东方佳艺影视公司联合拍摄电影《抗倭英雄吴时来》开拍（后改名《抗倭恩仇录》），由司小冬担任主导演，王冰扮演故事主角吴时来，故事讲述其在早年松江府任内进行抵抗倭寇的保卫战。
延伸阅读
吴时来（1527年 - 1590年），字惟修，号悟斋，諡忠恪，浙江台州府仙居县人，明朝政治人物，官至都察院左都御史。