生平
萬曆四十年(1612年)壬子科應天鄉試舉人,萬曆四十一年(1613年)聯捷癸丑科進士,授福州府推官,任內「政肅民和、豪強屏跡」,後來又升吏部文選司員外郎,謝絕請託,秉公辦事。為官以來以正直清廉,疾惡如仇而聲名在外。
天啟五年(1625年)魏大中被宦官魏忠賢陷害逮捕,路過蘇州吳門時,順昌親詣其船,要將女兒許配給大中之孫。抻解囚犯的旗尉趕忙催促上路,順昌破口大罵:「你不知道世間有不怕死的男子漢麼?回去告訴魏忠賢,我就是以前的吏部郎周順昌!」魏忠賢自恨之,而魏忠賢的義子倪文煥,也趁機彈劾周順昌與魏大中家通婚,並且誣告周貪污鉅款,周順昌於是被革職,但是魏忠賢仍未息怒。
應天巡撫周起元罷官,周順昌曾作文送他,文章有斥責魏忠賢閹黨之語。天啟六年魏忠賢假蘇杭織造太監李實誣攀,將順昌下錦衣衛鎮撫司詔獄。逮捕時激起蘇州人民反感,由於周順昌平日有德於民,上萬民眾上街爭奪周順昌,兩名東廠錦衣衛被當眾打死,後來五位民眾出面頂罪,避免蘇州居民被官府法辦,也被處死。復社領導人張溥《五人墓碑記》就是紀念這五人的作品。
順昌在獄中被錦衣衛許顯純拷打,要求他交出贓款三千兩銀,牙齒盡落,負責拷問的顯純問道「復能罵魏上公否?」,周順昌把滿口鮮血噴到許顯純臉上,駡聲更厲。許顯純只好半夜偷偷殺了順昌,年四十三。
身後
崇禎元年(1628年),崇禎帝追究閹黨,忠賢畏罪自殺,順昌追贈太常寺卿,諡忠介,加封其一個兒子。。有二子:長子周茂蘭(字子佩)及次子周茂藻(字子潔)皆為復社成員。周順昌侄女為明末清初醫者蔣示吉母。
明末清初戲曲家李玉與葉時章、朱素臣及畢魏等合著《清忠譜》以周順昌反抗魏忠賢而引發蘇州抗議事件而作。