高構弱冠任州主簿。出仕北齊，擔任河南王參軍事，歷任徐州司馬、蘭陵郡太守、平原郡太守。北齊滅亡後，被北周武帝任用為許州司馬。

隋朝建立，轉任冀州司馬，有才能之名。入朝任比部侍郎，轉任民部。內史侍郎晉平東與兄子晉長茂爭正嫡，尚書省不能斷決，朝臣三議也不能決。高構裁斷合理，隋文帝召他入內殿，慰勞他。轉任雍州司馬。一年後，轉任吏部侍郎。再任雍州司馬，因事連坐左遷盩厔縣令。隨後再任雍州司馬，入朝為吏部侍郎，因公事免職。

隋煬帝即位，高構擔任吏部侍郎。吏部中最有才能之人，前後典選的官員，都出于其下。高構好放談，有人認為他輕薄，但內里方正優雅，被吏部尚書牛弘看重。後因老病解職，人事上的問題，牛弘派使者到他家中諮問。611年，七十二歲時去世。

高構性格滑稽多智，喜好辯論，好讀書，擅長行政事務。他看重的人物杜如晦、房玄齡，後來成為唐朝開國的重要大臣，高構于是有了知人審才的好名聲。

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